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付録2. HPCIによるABCI利用

Note

本項では、HPCIの利用者の方を対象に、ABCIシステムのインタラクティブノードへのログイン、ファイル転送方法等を説明します。

インタラクティブノードへのログイン

ABCIシステムのフロントエンドであるインタラクティブノード (代表ホスト名:es) にログインするには、代理証明書を利用してHPCI 向けアクセスサーバ (ホスト名:hpci.abci.ai) にログインして、更にsshコマンドを用いてインタラクティブノードにログインする必要があります。なお本章では、ABCIのサーバ名はフォントをイタリックで表記します。

Linux / macOSなどの環境

gsisshコマンドでHPCI向けアクセスサーバ(hpci.abci.ai)にログインします。

[yourpc ~]$ gsissh -p 2222 hpci.abci.ai
[username@hpci1 ~]$

HPCI向けアクセスサーバにログイン後、sshコマンドを用いてインタラクティブノードにログインします。

[username@hpci1 ~]$ ssh es
[username@es1 ~]$

Windows環境 (GSI-SSHTerm)

インタラクティブノードへのログインは、以下手順で実施します。

  1. GSI-SSHTerm を起動
  2. ホスト名にHPCI向けアクセスサーバ(hpci.abci.ai)を入力し、ログイン
  3. sshコマンドを用いてインタラクティブノードへログイン

HPCI向けアクセスサーバにログイン後、sshコマンドを用いてインタラクティブノードにログインします。

[username@hpci1 ~]$ ssh es
[username@es1 ~]$

インタラクティブノードへのファイル転送

HPCI向けアクセスサーバではホーム領域が共有されていません。 そのため、インタラクティブノードへファイル転送をする場合、 一旦HPCI向けアクセスサーバ(ホスト名:hpci.abci.ai)へファイル転送し、 さらにインタラクティブノードへscp(sftp)コマンドで転送してください。

[username@hpci1 ~]$ scp local-file username@es:remote-dir
local-file    100% |***********************|  file-size  transfer-time

HPCI向けアクセスサーバ用ホーム領域の使用状況と割り当て量を表示するには、 quotaコマンドを利用します。

[username@hpci1 ~]$ quota
Disk quotas for user axa01004ti (uid 1004):
     Filesystem  blocks   quota   limit   grace   files   quota   limit   grace
      /dev/sdb2      48  104857600 104857600              10       0       0
項目 説明
Filesystem ファイルシステム
blocks ディスク使用量(KB)
files ファイル使用数
quota 上限値(ソフトリミット)
limit 上限値(ハードリミット)
grace 猶予期間

Note

HPCI向けアクセスサーバのホーム領域の割り当て量は100GBです。 不要になったファイルは削除してください。

HPCI共用ストレージのマウント

HPCI向けアクセスサーバでHPCI共用ストレージをマウントする場合は、mount.hpciコマンドを使用します。

Note

インタラクティブノードではHPCI共用ストレージはマウントできません。

[username@hpci1 ~]$ mount.hpci

マウント状況はdfコマンドで確認できます。

[username@hpci1 ~]$ df -h /gfarm/project-ID/username

HPCI共用ストレージをアンマウントする場合は、umount.hpciコマンドを使用します。

[username@hpci1 ~]$ umount.hpci

HPCI向けアクセスサーバと外部サービスの通信

HPCI向けアクセスサーバとABCI外部のサービス・サーバ間の通信は一部許可されています。 現在許可されていない通信に関しても、申請ベースで一定期間許可することを検討しますので、要望ありましたらサポートまで問い合わせください。

  • HPCI向けアクセスサーバからABCI外部への通信 以下のポートに関して通信を許可しています。
ポート番号 サービスタイプ
443/tcp https

Note

HPCI向けアクセスサーバからABCI外部のHPCIログインサーバへアクセスすることはできません。