GPU
ABCIシステムでは、NVIDIAが提供する以下のライブラリが利用できます。
- CUDA Toolkit
- NVIDIA CUDA Deep Neural Network library (cuDNN)
- NVIDIA Collective Communications Library (NCCL)
- GDRCopy: A fast GPU memory copy library based on NVIDIA GPUDirect RDMA technology
これらのライブラリを利用するためには、事前にmoduleコマンドを用いて利用環境を設定する必要があります。moduleコマンドを用いると、PATHなどの実行用環境変数や、ヘッダファイルやライブラリのサーチパスなどのコンパイル用環境変数を自動的に設定できます。
[username@g0001 ~]$ module load cuda/10.0/10.0.130.1
[username@g0001 ~]$ module load cudnn/7.4/7.4.2
[username@g0001 ~]$ module load nccl/2.4/2.4.8-1
以下では、ABCIシステムで利用可能なCUDA Toolkit、cuDNN、NCCLの一覧を示します。
CUDA Toolkit
| Major version | Minor version | Available from NVIDIA | Available on Compute Node (V) | Available on Compute Node (A) |
|---|---|---|---|---|
| cuda/9.0 | 9.0.176.1 | Yes | Yes | - |
| cuda/9.1 | 9.1.85.3 | Yes | Yes | - |
| cuda/9.2 | 9.2.148.1 | Yes | Yes | - |
| cuda/10.0 | 10.0.130.1 | Yes | Yes | Yes1 |
| cuda/10.1 | 10.1.243 | Yes | Yes | Yes1 |
| cuda/10.2 | 10.2.89 | Yes | Yes | Yes1 |
| cuda/11.0 | 11.0.3 | Yes | Yes | Yes |
| cuda/11.1 | 11.1.1 | Yes | Yes | Yes |
| cuda/11.2 | 11.2.2 | Yes | Yes | Yes |
| cuda/11.3 | 11.3.1 | Yes | Yes | Yes |
| cuda/11.4 | 11.4.4 | Yes | Yes | Yes |
| cuda/11.5 | 11.5.2 | Yes | Yes | Yes |
| cuda/11.6 | 11.6.2 | Yes | Yes | Yes |
| cuda/11.7 | 11.7.0 11.7.1 |
Yes | Yes | Yes |
| cuda/11.8 | 11.8.0 | Yes | Yes | Yes |
| cuda/12.0 | 12.0.0 | Yes | Yes | Yes |
cuDNN
計算ノード(V):
| Version | cuda/8.0 | cuda/9.0 | cuda/9.1 | cuda/9.2 | cuda/10.0 | cuda/10.1 | cuda/10.2 | cuda/11.0 | cuda/11.1 | cuda/11.2 | cuda/11.3 | cuda/11.4 | cuda/11.5 | cuda/11.6 | cuda/11.7 | cuda/11.8 | cuda/12.0 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7.0.5 | Yes | Yes | Yes | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 7.1.4 | - | Yes | - | Yes | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 7.2.1 | - | Yes | - | Yes | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 7.3.1 | - | Yes | - | Yes | Yes | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 7.4.2 | - | Yes | - | Yes | Yes | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 7.5.1 | - | Yes | - | Yes | Yes | Yes | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 7.6.5 | - | Yes | - | Yes | Yes | Yes | Yes | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 8.0.5 | - | - | - | - | - | Yes | Yes | Yes | Yes | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 8.1.1 | - | - | - | - | - | - | Yes | Yes | Yes | Yes | - | - | - | - | - | - | - |
| 8.2.4 | - | - | - | - | - | - | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | - | - | - | - | - |
| 8.3.3 | - | - | - | - | - | - | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | - | - | - |
| 8.4.1 | - | - | - | - | - | - | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | - |
| 8.5.0 | - | - | - | - | - | - | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | - |
| 8.6.0 | - | - | - | - | - | - | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | - |
| 8.7.0 | - | - | - | - | - | - | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | - |
計算ノード(A):
| Version | cuda/10.01 | cuda/10.11 | cuda/10.21 | cuda/11.0 | cuda/11.1 | cuda/11.2 | cuda/11.3 | cuda/11.4 | cuda/11.5 | cuda/11.6 | cuda/11.7 | cuda/11.8 | cuda/12.0 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7.3.1 | Yes | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 7.4.2 | Yes | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 7.5.1 | Yes | Yes | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 7.6.5 | Yes | Yes | Yes | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 8.0.5 | - | Yes | Yes | Yes | Yes | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 8.1.1 | - | - | Yes | Yes | Yes | Yes | - | - | - | - | - | - | - |
| 8.2.4 | - | - | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | - | - | - | - | - |
| 8.3.3 | - | - | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | - | - | - |
| 8.4.1 | - | - | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | - |
| 8.5.0 | - | - | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | - |
| 8.6.0 | - | - | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | - |
| 8.7.0 | - | - | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | - |
NCCL
計算ノード(V):
| Version | cuda/8.0 | cuda/9.0 | cuda/9.1 | cuda/9.2 | cuda/10.0 | cuda/10.1 | cuda/10.2 | cuda/11.0 | cuda/11.1 | cuda/11.2 | cuda/11.3 | cuda/11.4 | cuda/11.5 | cuda/11.6 | cuda/11.7 | cuda/11.8 | cuda/12.0 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2.4.8-1 | - | - | - | Yes | Yes | Yes | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 2.5.6-1 | - | Yes | - | - | Yes | Yes | Yes | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 2.6.4-1 | - | - | - | - | Yes | Yes | Yes | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 2.7.8-1 | - | - | - | - | - | Yes | Yes | Yes | Yes | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 2.8.4-1 | - | - | - | - | - | - | Yes | Yes | Yes | Yes | - | - | - | - | - | - | - |
| 2.9.9-1 | - | - | - | - | - | - | Yes | Yes | - | - | Yes | - | - | - | - | - | - |
| 2.10.3-1 | - | - | - | - | - | - | Yes | Yes | - | - | - | Yes | - | - | - | - | - |
| 2.11.4-1 | - | - | - | - | - | - | Yes | Yes | - | - | - | Yes | Yes | Yes | - | - | - |
| 2.12.12-1 | - | - | - | - | - | - | Yes | Yes | - | - | - | - | - | Yes | - | - | - |
| 2.13.4-1 | - | - | - | - | - | - | Yes | Yes | - | - | - | - | - | - | Yes | - | - |
| 2.14.3-1 | - | - | - | - | - | - | Yes | Yes | - | - | - | - | - | - | Yes | - | - |
| 2.15.5-1 | - | - | - | - | - | - | Yes | Yes | - | - | - | - | - | - | - | Yes | - |
| 2.16.2-1 | - | - | - | - | - | - | - | Yes | - | - | - | - | - | - | - | Yes | Yes |
計算ノード(A):
| Version | cuda/10.01 | cuda/10.11 | cuda/10.21 | cuda/11.0 | cuda/11.1 | cuda/11.2 | cuda/11.3 | cuda/11.4 | cuda/11.5 | cuda/11.6 | cuda/11.7 | cuda/11.8 | cuda/12.0 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2.4.8-1 | Yes | Yes | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 2.5.6-1 | Yes | Yes | Yes | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 2.6.4-1 | Yes | Yes | Yes | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 2.7.8-1 | - | Yes | Yes | Yes | Yes | - | - | - | - | - | - | - | - |
| 2.8.4-1 | - | - | Yes | Yes | Yes | Yes | - | - | - | - | - | - | - |
| 2.9.9-1 | - | - | Yes | Yes | - | - | Yes | - | - | - | - | - | - |
| 2.10.3-1 | - | - | Yes | Yes | - | - | - | Yes | - | - | - | - | - |
| 2.11.4-1 | - | - | Yes | Yes | - | - | - | Yes | Yes | Yes | - | - | - |
| 2.12.12-1 | - | - | Yes | Yes | - | - | - | - | - | Yes | - | - | - |
| 2.13.4-1 | - | - | Yes | Yes | - | - | - | - | - | - | Yes | - | - |
| 2.14.3-1 | - | - | Yes | Yes | - | - | - | - | - | - | Yes | - | - |
| 2.15.5-1 | - | - | Yes | Yes | - | - | - | - | - | - | - | Yes | - |
| 2.16.2-1 | - | - | - | Yes | - | - | - | - | - | - | - | Yes | Yes |
GDRCopy
計算ノード(V):
| Version | cuda/9.0 | cuda/9.1 | cuda/9.2 | cuda/10.0 | cuda/10.1 | cuda/10.2 | cuda/11.0 | cuda/11.1 | cuda/11.2 | cuda/11.3 | cuda/11.4 | cuda/11.5 | cuda/11.6 | cuda/11.7 | cuda/11.8 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2.3 | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | - | - |
計算ノード(A):
| Version | cuda/10.0 | cuda/10.1 | cuda/10.2 | cuda/11.0 | cuda/11.1 | cuda/11.2 | cuda/11.3 | cuda/11.4 | cuda/11.5 | cuda/11.6 | cuda/11.7 | cuda/11.8 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2.3 | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | Yes | - | - |
GPU Compute Modeの変更
ジョブ実行オプション -v GPU_COMPUTE_MODE=num を用いて、GPUのCompute Modeを変更することができます。以下の3つのCompute Modeが指定可能です。
| オプション | 説明 |
|---|---|
| -v GPU_COMPUTE_MODE=0 | DEFAULTモード。 1つのGPUを複数のプロセスから同時に利用できます。 |
| -v GPU_COMPUTE_MODE=2 | PROHIBITEDモード。 GPUへのプロセス割り当てを禁止します。 |
| -v GPU_COMPUTE_MODE=3 | EXCLUSIVE_PROCESSモード。 1つのGPUを1プロセスのみが利用できます。1プロセスから複数スレッドの利用は可能です。 |
インタラクティブ利用時の実行例:
[username@es1 ~]$ qrsh -g grpname -l rt_F=1 -l h_rt=1:00:00 -v GPU_COMPUTE_MODE=3
バッチ利用時の実行例:
#!/bin/bash
#$ -l rt_F=1
#$ -l h_rt=1:00:00
#$ -j y
#$ -cwd
#$ -v GPU_COMPUTE_MODE=3
/usr/bin/nvidia-smi